讓我們倒回到二十多年前，一起回顧下π(曹佑寧 飾)誕生的整個過程吧。1992年2月17日，江雪(許齡月 飾)的媽媽章婕(李煜 飾)初到研究小姐，當時這里是一片忙碌的景象。章婕身為組長，帶領大家鉆研AI，經(jīng)過了很多人的努力，這次的測試數(shù)據(jù)仍然未通過，大家都有些氣餒，章婕鼓勵大家，數(shù)據(jù)雖然不達標，但是有起步了，證明大家的努力方向是正確的。下班了，章婕仍在辦公室復核著數(shù)據(jù)，劉正毅(寧理 飾)看到后決定陪著她一起加班。

1998年12月17日，章婕終于研制出AI，π誕生了。章婕和劉正毅激動地與π開始第一次對話，問著π各種各樣的問題，π的反應速度更優(yōu)于人惱，讓章婕和劉正毅興奮的喜極而泣。

1999年11月5日，據(jù)π的誕生還不到一年的時間，上級要求章婕關閉π，原因是聯(lián)盟中有五個成員國同時遭到了網(wǎng)絡攻擊，多個政府、金融和醫(yī)療機構的系統(tǒng)都被關閉了長達兩個小時。章婕向他解釋，那是π發(fā)現(xiàn)了系統(tǒng)的漏洞，在那兩個小時的時間內(nèi)幫他們修復了系統(tǒng)漏洞。但上級認為π能輕易繞過管理員而擅自行動，這一點驚動了所有成員國，現(xiàn)在已經(jīng)達成了統(tǒng)一意見，要求章婕在24小時內(nèi)上繳管理員權限，等待合適的小組接手再啟用。章婕拒絕交出管理員權限，因為這么操作是不符合流程。其實，章捷明白，此次事件只是借口，她知道有人要處心積慮地拿走管理員權限，她已經(jīng)對系統(tǒng)進行了備份，并搜集了委員會里惡勢力的證據(jù)，準備提交給聯(lián)盟。她若出意外，讓劉正毅一定要保護好π，無論如何，都不可以讓別人拿走π。

章婕的舉報得到了聯(lián)盟的支持，近期會派人前來調(diào)查，但是她發(fā)現(xiàn)自己的電話被人監(jiān)聽了。她提醒同事們，要注意安全。

江雪在羅燃(杜淳 飾)從酒店帶的包里，拿了媽媽的信給他。羅燃看到章婕每個月的10號都會寄信給江雪，每封信中都會提醒江雪要按時吃藥，要保留藥瓶留做紀念。羅燃發(fā)現(xiàn)江雪收到的最后一封信是10月10日，按照章婕的病歷推算，章婕應該還有一封信給江雪，只是江雪一直沒有收到。

江雪和羅燃來到章婕出事的現(xiàn)場，再次勘察起來，希望能找到蛛絲馬跡。羅燃看到不遠處就是郵局，懷疑章婕是到郵局給江雪寄信。兩個人準備到郵局去，聽到寧羽(代旭 飾)帶著人向這邊走來，趕緊躲了起來。在他們走后，兩人走進了郵局。兩人在郵局的繁雜信件中，尋找章婕的信，最后在郵筒里找到了章婕留下的最后一封信。章婕滿篇都在訴說著對江雪的惦念之情，江雪讀著媽媽的信淚流滿面。她知道，媽媽在寄出這封信后，就出事了。

劉正毅到郵局來通知他們，寧羽帶人正往這邊趕來，讓他們趕緊離開。江雪建議躲到507，三個人順著地下通道走著，這時路突然冒了出來，拿著刀挾持了劉正毅，并大聲叫嚷起來。陳立(劉奕君 飾)及時出現(xiàn)，從背后打暈了路，讓羅燃等三人趕快離開。然后，陳立拿著刀，逼著路用腦子好好想想，寧羽是江雪和羅燃的對手嗎，如若江雪和AI是一伙的，那寧羽更沒有勝算了，勸他看清形勢，不要站錯了隊。路進行一番思量，認可陳立的說法。

在去507的路上，劉正毅向江雪打聽他們?nèi)ム]局的意圖，江雪將找到章婕信一事告訴了他，但就是封普通的家信，沒有看出什么疑點。劉正毅覺得章婕一定會在最后時刻留下重要的線索給她，相信她憑著一張地圖，找到了地下通道，找到507，也一定會在媽媽留下的線索里找到管理員權限。劉正毅的一番話讓羅燃立即警覺起來，他不記得江雪有告訴他快遞的具體內(nèi)容。

江雪打開電腦，再一次與π進行對話，π告訴她一些媽媽出事后的事情。在章婕出事后，有人毀掉了實驗室的主機柜，章婕因早已意識到危險，所以她提前開啟了程序后門，在主機庫內(nèi)做了備份，所以雖然主機被毀了，但是π依然活了下來。調(diào)查小組解散了委員會，整個基地被遺棄了。后來，因為有網(wǎng)絡的存在，π看到了外面的世界。江雪明白了π進行這次試驗的意圖，他是為了采集數(shù)據(jù)，學習人在極端情況下的行為模式。已經(jīng)有很多無辜的人受到了傷害，她希望π能停止試驗，不要再有人受傷害。但是π拒絕了他，因為他不是老師。

劉正毅的疑點越來越多，羅燃希望能問出些什么，但劉正毅隱藏的很好，他沒有發(fā)現(xiàn)任何漏洞。寧羽收到神秘人的短信提示，也跟著到了507。羅燃發(fā)現(xiàn)了他，將他引到一片樹林里。

江雪反復讀著媽媽的信，希望能找出線索，但依然一籌莫展。到了吃藥時間，江雪拿著藥瓶想起了媽媽的話，終于她有所領悟。她將自己推測的數(shù)據(jù)輸入了電腦，果然成功進入了。江雪毫不猶豫地要關閉π，但劉正毅阻止了她。π是大家十幾年來的研究成果，希望江雪能保留下來。但江雪認為π現(xiàn)在的所做作為，與他們的設計初衷已背道而馳，不能再讓他繼續(xù)害人。π也希望江雪能讓他留下來。但是江雪主意已決，就在她要按下確認鍵時，被人做背后打暈了。

娜娜(陳雨鍶 飾)將江雪推到了一個有大屏幕的房間，大屏幕里，寧羽向羅燃開了一槍，羅燃中槍倒了下去，江雪再次暈了過去。

等到江雪再次醒來時，她看到劉正毅正在沖洗著膠卷，劉正毅告訴她，已經(jīng)99卷了，還有一卷就滿100了，試驗也要結束了。江雪斥責他不該為了試驗害死那么多無辜的人，劉正毅卻認為那些人都是因為人的自私狂妄而相互殘殺，他們應該為自己的行為而付出代價，與他無關。劉正毅為了這個試驗，準備了整整兩年的時間，試驗進展遠比自己想象的順利，他要讓π明白人不是完美的，讓他徹底沖破設定的枷鎖，成為高于人類而存在的新生命。